L’église Saint Nizier est édifiée en grande partie aux XIVe et XV siècles. Elle représente face à la primatiale Saint Jean, l’église des bourgeois.
La deuxième moitié du XVIe siècle voit les travaux s’accélérer avec la construction du portail renaissance (1579).
L’aspect actuel de l’édifice tient beaucoup aux travaux de l’architecte Benoît au 19e siècle (clocher sud).