#cell #cellule #chromatine #loci #génomique Imagerie de l’Organisation 3D et de l’Activité Transcriptionnelle de la Chromatine à l’Échelle Génomique

 Multiplexed chromatin tracing = Repérage de la chromatine multiplexé
High resolution chromosome traces = Empreintes de chromatine à haute résolution
Multiplexed RNA imaging = Imagerie de l'ARN multiplexée
Protein imaging = Imagerie des protéines
Genome-scale chromatin traces = Empreintes de chromatine à l'échelle du génome
transciption & nuclear organization = organisation transcriptionnelle et nucléaire
Single-cell domains = Domaines chromatiniens de cellules uniques
Nascent RNA = ARN naissant (transcrit)
Speckles = Mouchetures d'épissage

L’organisation tridimensionnelle (3D) de la chromatine soumet à régulation un grand nombre de fonctions génomiques. Notre compréhension de l’organisation 3D du génome nécessite des outils pour visualiser directement la conformation chromatinienne dans son contexte physiologique normal. Ici, nous faisons le compte rendu d’une technique de visualisation de l’organisation de la chromatine à divers niveaux au niveau d’une cellule unique à l’aide de techniques génomiques à haute capacité. Tout d’abord, nous dévoilons l’imagerie multiplexée des centaines de loci génomiques par hybridation séquentielle, qui permet une visualisation à haute définition des chromosomes entiers. Ensuite, nous rendons compte d’une méthode d’hybridation in situ par fluorescence (MERFISH) pour le suivi de la chromatine et réalisons l’imagerie simultanée de plus de 1000 loci génomiques et transcrits naissants (d’ARN)* de plus de 1000 gènes ainsi que leur délimitation nucléaire associée. À l’aide de cette technologie, nous caractérisons les domaines chromatiniens, les compartiments et les interactions trans-chromosomiques ainsi que leurs liens fonctionnels avec la transcription au niveau des cellules uniques. Nous envisageons une application étendue et différentes échelles de cette technologie d’imagerie multimodale à haute capacité ; qui fournit une vision intégrée de l’organisation de la chromatine dans son environnement structurel et fonctionnel natif. Jun-Han Su, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 20 août 2020

*rajout de l'éditeur (NZ) du présent post de blogSource iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct/ Traduction et adaptation : NZ