MOMA = Analyse Multiomique d'un Régulateur Majeur
Malgré le déploiement d’efforts considérables, les mécanismes liant les altérations génomiques à l’identité transcriptionnelle du cancer restent insaisissables. L’analyse génomique intégrative, utilisant une approche basée sur les réseaux, a identifié 407 protéines régulateurs majeurs (MR) responsables de la canalisation de la génétique sur des échantillons provenant de 20 cohortes répertoriées dans l’Atlas du génome du cancer (TCGA) dans 112 sous-types de tumeurs distinctes sur le plan transcriptionnel. En approfondissant, les protéines MR pourraient être organisées en 24 bloc-modules majeurs (MRBs) couvrant l’ensemble des types de cancers, chacun d’entre eux soumettant à régulation les étapes de développement du cancer et prédictifs du sort du patient dans des cohortes multiples. De toutes les altérations somatiques détectées chez chaque échantillon pris individuellement, > 50% était prédictifs de l’induction d’une activité MR aberrante, donnant un éclairage des mécanismes établissant un lien entre génétique des tumeurs et identité transcriptionnelle ; établissant ce faisant des dépendances non-oncogènes. Les essais de validation génétique et pharmacologique ont confirmé l’effet prédit de mutations en amont et de l’activité MR sur l’identité et le phénotype cellulaire en aval. Ainsi, l’analyse combinée de l’expression des mutations et des gènes a identifié des sous-types insaisissables et fourni des hypothèses testables concernant les mécanismes de mécanismes de médiations des effets des altérations génétiques. Evan O. Paull, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 11 janvier 2021
Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ
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