#thelancetinfectiousdiseases #éditorial #monkeypox #épidémie Suivi de l'épidémie de monkeypox de 2022 avec des données épidémiologiques en temps réel

Graphe montrant la rapide diffusion du virus monkeypox (variole du singe) - en nombre total de cas (histogrammes bleus) et en pays touchés (courbe rouge) lors de l'épidémie de 2022

 

Le virus monkeypox a été documenté pour la première fois chez l'homme dans les années 1970 et des épidémies ont été signalées dans de nombreux pays, la plupart des cas étant limités aux zones endémiques. Début mai 2022, des cas de monkeypox ont été signalés au Royaume-Uni, en Espagne et ailleurs en Europe.

Le modèle de dispersion géographique était beaucoup plus important que les épidémies passées qui étaient plus localisées et se produisaient souvent dans des communautés défavorisées.3 La taille des grappes d'épidémies augmente chaque jour, tout comme la répartition géographique en Europe et en Amérique du Nord. Au cours de la première semaine du rapport initial, 24 pays ont signalé des cas suspects et confirmés de virus monkeypox, dont certains avaient des liens de voyage connus vers le Royaume-Uni, l'Espagne, le Canada et l'Europe occidentale. Au 5 juin 2022, il y avait 920 cas confirmés et 70 cas suspects. Sur 64 cas confirmés avec des antécédents de voyage connus, 32 étaient associés à des voyages en provenance d'Europe, trois d'Afrique de l'Ouest, deux du Canada et un d'Australie. Pour 26 cas, les lieux d'antécédents de voyage restent inconnus.

L'OMS a convoqué une réunion d'experts et de groupes consultatifs techniques le 20 mai 2022, pour enquêter sur les causes de l'épidémie et a publié des directives actualisées sur la surveillance, l'investigation des cas et la recherche des contacts. La raison pour laquelle l'épidémie a une portée géographique plus large est étudiée par la communauté internationale et nationale de la santé publique et la communauté des chercheurs, contribuant à une compréhension à plus grande échelle de la dynamique de l'épidémie. Cependant, l'arrêt des programmes de vaccination contre la variole, l'empiètement des humains dans les zones forestières et la mobilité internationale croissante semblent jouer un rôle important dans l'épidémiologie des épidémies de virus du monkeypox.

Pour soutenir les efforts de réponse mondiaux, notre équipe a créé une base de données et une visualisation en libre accès pour suivre l'apparition de cas dans différents pays. De plus, le cas échéant, nous avons ajouté des informations sur l'âge (agrégées en tranches d'âge, avec une fourchette minimale de 5 ans), le sexe, les dates d'apparition des symptômes et de confirmation en laboratoire, les symptômes, les lieux (agrégés au niveau de l'État), les antécédents de voyage, et métadonnées supplémentaires définies par l'OMS. 

Les données sont compilées à partir de sources vérifiées, y compris les rapports des gouvernements et des organisations de santé publique et les reportages des médias sur les déclarations officielles de la santé. Au fur et à mesure que des informations vérifiées et des déclarations officielles sont publiées, nous documentons les sources secondaires et mettons à jour les métadonnées dans l'ensemble de données. Un horaire d'astreinte pour les conservateurs fonctionnant 24h/24 et 7j/7 a été établi pour assurer la mise à jour des données en temps quasi réel. Chaque cas est vu et discuté par au moins deux conservateurs avant d'être mis à disposition via notre référentiel Global.health GitHub, et poussé vers la visualisation de la carte au moins quatre fois par jour.

Au cours des premiers stades des épidémies, obtenir des données fiables et synthétisées sur les caractéristiques des cas est un défi, en particulier à l'échelle mondiale. Notre travail tente d'harmoniser les informations entre les pays et de fournir des données supplémentaires pour soutenir la compréhension épidémiologique des origines et de la dynamique de transmission de cette épidémie. Idéalement, ces données sont associées aux données génomiques du virus et intégrées directement aux données épidémiologiques de la liste des pays. Dans notre référentiel, nous travaillons également avec des collègues et le Hub de l'OMS pour le renseignement sur les pandémies et les épidémies pour définir un schéma de données de contact permettant aux pays et aux chercheurs d'estimer et de réestimer les paramètres épidémiologiques clés, tels que la période d'incubation et l'intervalle de série, à travers différents réglages.

Des données en temps réel sont nécessaires pour planifier des mesures de contrôle efficaces si cette épidémie se développe davantage. Le travail s'appuie sur l'infrastructure développée pour le contrôle des épidémies et la préparation à la pandémie et a été utilisé pour la pandémie de COVID-19.7 Des efforts mondiaux sont nécessaires pour garantir que des efforts similaires pour harmoniser et publier rapidement des données épidémiologiques détaillées soient soutenus lors de futures épidémies d’agents pathogènes émergents et ré-émergents. Cet exemple sera une voie d'apprentissage pour construire de meilleurs systèmes de surveillance à l'échelle mondiale. Moritz UG Kraemer, et al, dans The Lancet Infectious Diseases, publication en ligne en avant-première, 8 juin 2022

Financement : Fondation Rockefeller

Source : The Lancet Online / Préparation post : NZ